Die Burgergemeinde der Stadt Freiburg ist für die Verwaltung der verschiedenen Institutionen der Burgergemeinde zuständig.
Im Gegensatz zu anderen Burgergemeinden in der Schweiz ist die Burgergemeinde der Stadt Freiburg eine Verwaltungsabteilung (Dikasterium) der politischen Gemeinde. Sie besitzt zwar eine unabhängige Verwaltung, wird jedoch von einem Gemeinderat, dem Präsidenten der Kommissionen der Burgergemeinde, geleitet.
Der Gemeinderat genehmigt die Budgets und die Rechnungen sowie sämtliche Traktanden, die an der Burgerversammlung, dem obersten Organ der Burgergemeinde, vorgelegt